成化十三年二月，汪直心腹錦衣衛(wèi)百戶韋瑛稱楊榮之曾孫楊業(yè)家貲巨萬，常殺人，將招納亡命下海。汪直發(fā)兵籍沒福建都指揮楊業(yè)，詞語牽連連兵部主事楊仕偉、中書舍人董璵，俱下獄瀕死。韋瑛并籍其家。三月，左都御史李賓奏擬妄報妖言者連坐處斬，而當時西廠旗校即以捕妖言圖官賞，從而大量百姓被捕冤死。同年四月，汪直令韋瑛逮捕通政使司左通政方賢、太醫(yī)院判蔣宗武下西廠獄;當時禮部郎中樂章、行人張廷網出使安南歸還，刑部郎中武清從廣西勘事歸還，浙江布政使劉福起復至京師，均被汪直并令韋瑛逮捕。御史黃本在云南、貴州清軍刷歸還，汪直令韋瑛搜得一個象笏，被逮捕送錦衣衛(wèi)，被被貶為民。

同年五月，因為當時汪直開西廠，羅織數起大獄，百姓害怕，大學士商輅上疏稱請革去西廠，罷汪直并誅韋瑛;并與憲宗發(fā)生爭執(zhí)，憲宗最後批準此疏，罷免西廠。并謫韋瑛戍宣府。西廠的廢除并沒有直接導致汪直勢力的衰弱，很快汪直恢復御馬監(jiān)職位。同年六月，御史戴縉、王億等人因多年無法升遷，於是依附汪直，進言稱汪直為官“直釐奸剔弊，允合公論”、“汪直所行，不獨可為今日法，且可為萬世法”，并請求恢復西廠。憲宗大喜，并恢復西廠。

此事前後，左都御史王越因西征而與韋瑛相識，此後交往甚深，之後依附汪直。王越屢次想取代項忠的兵部尚書之職。恰逢當時項忠率領九卿彈劾汪直，兩人在朝堂上亦辭色甚厲。此後汪直命東廠官校，發(fā)江西都指揮劉江、指揮黃賓等事誣陷詆毀項忠。此時給事中郭鏜、御史馮瓘因依附汪直而交相彈劾項忠。項忠在朝廷上慷慨激辯而仍然下獄，竟連坐削籍。兵部武選郎中、姚璧(尚書姚夔之子)亦因聯系九卿而彈劾汪直，亦被降職調。不久，大學士商輅、尚書薛遠、董方，左都御史李賓一同致仕;而依附汪直的王越擔任兵部尚書兼左都御史掌都督院事。十一月，汪直黨羽御史馮瓘為大理寺丞，戴縉為尚寶司少卿，后擢升僉都御史;王億為湖廣按察副使。成化十四年五月，汪直請奏請武舉設科，鄉(xiāng)、會、殿試如進士例。

成化十四年(1478年)，海西兀者都指揮散出哈上書，言開原驗放管指揮索其珍珠豹皮。憲宗命遼東守臣勘查，管指揮者懼。恰逢當時散出哈侄產察入貢而指揮賄賂的事情，后經調查證明是誣陷。此後又散出產察發(fā)怒，謀聚眾入犯邊界。守臣於是翻譯番書，招散出哈來廣寧當面對峙，此後發(fā)生爭執(zhí)，散出哈糾結部隊入邊，戰(zhàn)事一觸即發(fā)。汪直聽聞心腹王英之言，以為鎮(zhèn)撫遼東可以立功，於是請求前往。憲宗欲批準，而司禮監(jiān)懷恩認為汪直年少喜功，於是去南閣，召集兵部尚書余子俊、兵部侍郎馬文升商議。隨後舉薦馬文升、詹升前往。汪直欲令王英與其一同前往，馬文升婉言拒絕了，因此招致汪直憤恨。

馬文升赴任巡撫后，命貢使重陽歸諭其眾，告訴明朝廷旨意。然而當時海西縱容部隊進犯，馬文升於是擊敗后再加以安撫。事情傳到朝廷中，汪直稱：“既然說安撫怎麼又來進犯邊界？”於是向朝廷請求親自前往。遼東各部聽聞汪直擅政，不肯去接受器安撫。汪直行至開源，馬文升在撫順，汪直亦不與其聯系會合。於是馬文升招撫的兀者、野人、堵里吉三百馀人皆怒欲歸。參將周俊恐怕此事白，於是對汪直稱必須請馬文升見面。此後馬文升抵達后，汪直問解決方略，馬文升稱：“太監(jiān)既至，此屬即太監(jiān)招出者也，何間彼此。”汪直知道此事不易解決，於是聽聞馬文升建議，一同抵達遼陽，再將事情匯報憲宗。

成化十五年(1479年)，陳鉞擔任遼東巡撫，因不瞭解當地事務，而被馬文升調換，并約束其舉動。汪直抵達遼東后，陳鉞身著戎服伏道左邊，為其掃路裝飾廚房，并使得其住宿舒適。唯獨馬文升仍與汪直分庭抗禮，對并其隨從頤指，隨從遂詆毀馬文升。陳鉞借此再次誣陷馬文升因禁農器，不與交易，而招致外部入寇。同年六月，憲宗命汪直同刑部尚書林聰即訊遼東事，馬文升被逮捕下錦衣獄，謫戍重慶。

同年十月，遼東巡撫陳鉞請求討伐海西，憲宗命以撫寧侯朱永為總兵，陳鉞提督軍務，汪直監(jiān)軍。汪直抵達遼東后，有頭目郎秀等四十人入貢，在廣寧遇到汪直，汪直誣陷其為窺伺於是掩殺，并以捷報上報。論功，加汪直歲祿，監(jiān)督十二團營;朱永進保國公，陳鉞為戶部尚書。至此，海西諸部以復仇為辭，深入云陽、青河堡等，殺掠男婦，皆支解屍體以報仇。邊將斂兵不出，陳鉞亦隱匿不上報此事。而此時，依附汪直的太仆少卿王宗彝(大學士王文之子)為僉都御史、擔任遼東巡撫。

成化十六年(1480年)正月，給事中孫博上疏彈劾東廠、西廠中傷大臣;卻遭到憲宗指責。同年三月，憲宗命汪直、保國公朱永、尚書王越率兵出塞，在威寧交戰(zhàn)，并獲勝，王越封威寧伯。同年四月，遼東巡按御史強珍上疏，彈劾此前太監(jiān)汪直、總兵侯謙、巡撫陳鉞失機隱匿的事情。都給事中吳原、御史許進等上奏，并將陳鉞比喻為宋朝的黃潛善、賈似道。憲宗下詔罰陳鉞俸祿，陳鉞因而怨恨王越掌都督院事而縱容強珍。汪直正在巡邊還京中，陳鉞在郊外五十里相迎，訴強珍承奉王越旨意彈劾他。汪直大怒，王越亦來迓，汪直不見王越。巡撫遼東王宗彝遂阿汪直旨意，誣陷強珍妄奏，逮捕強珍至京，下錦衣衛(wèi)獄，戌遼東。

同年七月，汪直上議征討安南，要求調取明成祖朱棣當年征討安南的兵馬數量與圖冊。當時劉大夏在兵部職方司任職，故意藏匿安南的典冊，并向兵部尚書余子俊陳述出兵安南利害，并極力勸阻，此事最終不了了之。成化十七年(1481年)八月，亦思馬因入寇大同，憲宗以威寧伯王越佩征西前將軍印鎮(zhèn)守，汪直任監(jiān)軍。同年十月，巡撫宣府都御史秦紘密疏汪直縱旗校擾民，憲宗竟釋放汪直。