1187年，朱熹出任江南西路提點(diǎn)刑獄公事，幾年后受當(dāng)時(shí)南宋宰相趙汝愚推薦，當(dāng)上煥章閣侍制兼侍講，即皇帝的顧問和老師。即位不久的南宋寧宗全面肯定了理學(xué)，稱朱為“儒宗”，充分反映了偏安江南的南宋朝廷企圖以理學(xué)加強(qiáng)內(nèi)部團(tuán)結(jié)的愿望。

宋寧宗時(shí)的權(quán)臣韓侂胄由于結(jié)黨營(yíng)私，驕奢淫逸，為“滅人欲”的理學(xué)家所鄙視。隨著慶元元年支持理學(xué)的趙汝愚被罷相，韓侂胄等趁機(jī)發(fā)動(dòng)了一場(chǎng)抨擊“理學(xué)”的運(yùn)動(dòng)，斥理學(xué)為“偽學(xué)”。寧宗也一改舊態(tài)，將朱熹逐出朝廷，下詔命凡薦舉為官，一律不取“偽學(xué)”之士。大小官員在寫述職報(bào)告時(shí)，還要多加上一句“不是偽學(xué)黨中人”，歷史上稱為“慶元黨禁”。

監(jiān)察御史沈繼祖彈劾朱熹，羅列朱熹十大罪狀中包括“誘引尼姑二人以為寵妾，每之官則與之偕行”，“家婦不夫而孕”。指控朱熹貪色好淫，曾經(jīng)引誘兩個(gè)尼姑作寵妾，出去做官時(shí)還帶在身邊招搖過市。他家中的兒媳則在丈夫死后還懷上身孕，有了“公公扒灰”的可疑。這對(duì)提倡“存天理，滅人欲”和“三綱五常”的朱熹來說，簡(jiǎn)直是置于人格死地的重磅炸彈。

慶元六年三月初九，71歲的朱熹終于在建陽家中憂憤而死。臨死還在修改《大學(xué)誠意章》，可見他是如何矢志于樹立自己的理學(xué)，然而生前終未如愿。

使朱熹得以翻身如愿，并名揚(yáng)天下的則是南宋權(quán)臣史彌遠(yuǎn)。史彌遠(yuǎn)，字同叔，明州鄞縣(今寧波鄞州)人，淳熙十四年進(jìn)士。開禧三年﹐韓侂胄北伐失敗﹐金朝來索主謀，時(shí)任禮部侍郎的史彌遠(yuǎn)串通楊皇后殺死韓侂胄，送其首級(jí)與金人請(qǐng)和，史彌遠(yuǎn)因此取代韓侂胄升任右丞相兼樞密使，分別在寧宗朝獨(dú)相17年、理宗朝獨(dú)相9年，共執(zhí)掌南宋朝政長(zhǎng)達(dá)26年之久。

為了更好地鞏固自己的地位，運(yùn)用理學(xué)為宋王朝服務(wù)，史彌遠(yuǎn)取代韓侂胄擔(dān)任丞相后，不但恢復(fù)了支持理學(xué)的趙汝愚、呂祖謙等人的官職，還召林大中、樓鑰等15位故老入朝。同時(shí)，恢復(fù)了理學(xué)的地位，下令雕版印行朱熹的著作。由于史彌遠(yuǎn)的撥亂反正，使本已奄奄一息的朱熹理學(xué)，成了元明清三朝的官方哲學(xué)。元朝皇慶二年復(fù)科舉，詔定以朱熹《四書集注》試士子，朱學(xué)定為科場(chǎng)程式。朱元璋洪武二年正式確定科舉以朱熹的“傳注為宗”，作為科舉考試評(píng)卷的標(biāo)準(zhǔn)答案。

史彌遠(yuǎn)一直得到宋寧宗、理宗的信任，封官加爵不已，紹定六年病死，追封衛(wèi)王，謚忠獻(xiàn)，歸葬故鄉(xiāng)東錢湖。今日寧波東錢湖仍存史彌遠(yuǎn)墓葬遺址。