1928年4月5日，國民革命軍在徐州誓師，開始了對北洋軍閥的“第二次北伐”。此次“北伐”實際是國民黨新軍閥與北洋政府時期的老軍閥之間，爭奪中國北方統治權的混戰。國民革命軍挺進華北，勢如破竹。在山東戰場，國民革命軍第1、2集團軍先后重創魯軍，張宗昌倉皇逃往德州，孫傳芳也率殘部向北撤退。5月1日北伐軍進占濟南。5月下旬，國民革命軍主力各部開始向津京地區進軍。6月初，奉系軍閥首領張作霖見大勢已去，被迫發表“出關通電”，命令部隊退出北京，撤回東北。6月4日清晨，張作霖的專列在皇姑屯附近被日軍預埋的地雷炸毀，張作霖因傷勢過重，不治身亡。繼任者張學良頂住日本侵華勢力的威脅利誘，毅然通電宣布與南京方面停止軍事行動，“決不妨礙統一”。張學良又指派邢士廉、王樹翰、徐祖治等人，到北平與蔣介石、馮玉祥、李宗仁等商談東北易幟，歸順中央等問題。接著，雙方便商定了東北易幟的大計。

此番波瀾壯闊的關內混戰聲勢浩大，也震撼了遠在邊隘的新疆省。面對“二次北伐”的大好形勢，樊耀南異常興奮。他一改過去謹小慎微的常態，決定采取孤注一擲和先發制人的策略，抓住時機，加快除楊行動。

不久，在新疆外交署的后花園，樊耀南與張純熙、張馨、呂藻如等人密謀具體行動方案。經反復研究，他們認為，省政府人多眼雜，不易下手，事后不便逃脫。若在楊外出時行刺，又難對付楊周圍眾多的衛兵。

最終，大家認定在楊增新常去的俄文法政專門學校動手比較穩妥。因為這里是樊耀南等人開展反楊活動的據點，部署和執行刺楊計劃都很方便。

俄文法政專門學校于1924年由楊增新創辦，主要課程有俄文、刑法、憲法、國際法、世界語等。該校由省教育廳廳長劉文龍主管，張純熙任教務主任。楊增新之所以在新疆辦這個師范學校，是為了培養死心塌地忠于自己、留在新疆的對俄外交人才。在學校里，上上下下差不多都是楊增新派的人。楊增新把俄文法政專門學校看成自己培養人才的地方，雖然平時不輕易去，但在學生畢業時，一定會去參加畢業典禮，對自己培養的這一批人才親自見面叮囑一番。樊耀南認為這是一個絕好的刺楊機會。

1928年7月初，楊增新重新擬定了新疆省政府委員會組成人員名單，以上報南京政府批準。在這份名單中，原來的各廳道負責人的官職基本照舊，唯獨勾掉了樊耀南的名字。

不久，樊耀南獲悉這份名單的內容，心中異常不滿。7月5日，樊耀南找到正在新疆的科學考察團團長徐炳祠，訴說憤恨之情：“這次的所謂新政府，只有委員會，沒有委員，看來，楊還是保持他的個人專制局面。他以為他的辦法行得通，我看，他不曉得各省的怪人在這邊的多得很，一定要出事的！”

1928年7月7日上午，新疆省立俄文法政專門學校在校園內舉行第一屆畢業生典禮。該校第一屆畢業生共44人，分別來自漢、回、維、滿、錫伯等五個民族。作為新疆“最高學府”的首屆畢業生典禮，是省內一件大事，自然安排得十分隆重，校園里一派歡慶的節日氣氛。楊增新與各廳道軍政要人、蘇聯領事等都應邀參加了典禮。

教務主任張純熙是湖北人，從北京俄文專修館畢業后，借著樊耀南的關系從內地來到新疆。這是樊耀南在與楊增新的斗爭中感到很滿意的一著棋。楊增新從未料到張純熙就是他的政敵為自己布下的一顆定時炸彈。

典禮之前，張純熙受樊耀南的囑托，專門負責迎接政府要員，他的主要任務是尋找時機指揮殺手刺楊。省府要員紛紛帶著隨從走進校門，卻唯獨不見楊增新露面，張純熙不免有些焦急。

忽然，門外一片嘈雜，只見楊增新帶著私人衛隊，大搖大擺地走進校門。

張純熙稍微穩定了一下情緒，急忙面帶微笑地迎上前去恭敬地招待。隨后，他一直站在楊增新的身邊，殷勤地侍候著，同時暗中注意楊的一舉一動。

按事先計劃，樊耀南等準備在典禮儀式結束后的全體照相時刺殺楊增新。不料，隨楊增新而來的旅長杜發榮非常警覺，他發現楊增新周圍的雜人很多，張純熙又始終不離楊的左右，便向張厲聲喝道：“你是什么人？如果沒什么事的話，請你不要再待在大帥身旁！”

張純熙不得不找個借口離開楊增新，急忙與樊耀南碰頭商量對策。為防意外發生，他們臨時決定，將刺楊行動改在典禮后的宴席上。

上午，典禮儀式開始后，由楊增新致辭。他對應屆畢業生的學習成績大加贊賞，并鼓勵他們今后要更加努力地工作，為建設新疆效勞。隨后，他和各政要親自給學員頒發了畢業證書并集體合影留念。

正午時分，畢業典禮圓滿結束，樊耀南以學堂監督的身份，在學校教室設宴席招待各位官員及嘉賓。這時，政務廳長金樹仁借口自己“案牘山積，亟待處理”，帶著秘書長屠文沛、科長王之佐等人提前離校，其他人都興高采烈地紛紛入席。

酒席共擺了三桌，楊增新與建設廳長閻毓善、旅長杜發榮、迪化道尹李溶及錢桐居中一桌，由一個漢文教員作陪。樊耀南陪同蘇聯領事加烏爾夫婦坐在靠西邊的一桌。楊增新的衛隊長高連斗與楊的副官張子文、王祉、冒維新等人被安排在東廂房，楊的衛隊人員則被安排在院外的一間屋里用餐。

此時，楊增新想到幾十名首屆畢業生將成為自己今后統治新疆的“人才”，心情十分愉快，在宴席上談笑風生。他原定飯后去陸軍學校訓話，便一邊催著快上菜，一邊與身旁的人高聲猜起拳來。

席間菜肴豐盛，賓客們不斷碰杯相慶，現場氣氛歡樂而輕松。上了幾道菜，酒至數巡以后，張純熙忽然從門外快步走進來，他微笑著拿起一把酒壺，又不經意地失手將酒壺摔在桌子上，發出一聲脆響。

接著，樊耀南向張純熙大聲問道：“酒菜都備齊了嗎？”

張立即回答：“備齊了！”這正是樊耀南與張純熙事先約定的執行刺殺行動的暗語。

聽到張純熙的回答，樊耀南站起身向蘇聯領事舉杯敬酒。

就在樊耀南與蘇聯領事兩名酒杯相碰的一瞬間，走到中間桌上菜的一名穿著藍布長衫、身材矮小的侍者，猛然甩掉手中的菜碟，迅速拔出手槍，將黑洞洞的槍口對準了毫無防備的楊增新。

此人叫劉錦臣，原是從蘇聯歸國的華僑團長劉連科的馬弁，因劉連科被楊增新所殺，故一直伺機為故主復仇。

楊增新被意外狀況驚呆了，兩眼緊盯著劉錦臣，一時不知所措。

“砰！”隨著一聲震耳欲聾的槍聲，楊增新的胸部中彈，鮮血立即涌出。這槍并未致命，楊增新猛然明白自己遇刺了，他聲嘶力竭地叫道：“干什么？”同時以手撐桌，顫顫悠悠地試圖站起來。

不料，又有幾個身穿藍布長衫、侍者打扮的人沖進屋里，一齊舉槍向楊射擊。楊增新身上又連中數彈，終于倒在地上，素來喜歡在酒宴上殺人的楊增新，不料自己也栽在了酒席上。

與此同時，旅長杜發榮還沒來得及反抗，就被殺手有預謀地打中要害，一頭栽倒在餐桌旁。建設廳長閻毓善的胳膊也被擊中一彈，他忍痛順勢倒地，趴在楊增新的身邊裝死。蘇聯領事加烏爾夫婦早已嚇得魂飛膽戰，慌忙逃到門外，躲進廁所，以免被誤傷。

楊增新的副官和衛士聽到槍聲，立即趕來救楊。然而，他們的槍支早已被人暗中收繳，只好赤手空拳地闖進屋里。

副官張子文搶先以手去扶楊增新，被一槍打死。衛隊營長高連斗撲在楊增新的尸體上試圖擋子彈，也身中數彈，當即斃命。

樊耀南見大功告成，便指揮手下眾人迅速撤離現場。臨行前，樊耀南害怕楊增新不死，又從身邊一名隨從手中接過槍，咬牙切齒地朝楊增新的胸口補了兩槍。

楊增新氣絕身亡，時年64歲。這個統治新疆17年的“塞外皇帝”就這樣結束了他的一生。

當樊耀南向楊增新補槍時，趴在地上裝死的閻毓善禁不住挪動了一下，被人發現又朝他腿上打了一槍。閻毓善嚇得不敢再動。約莫半個鐘頭之后，閻毓善隱約看到有人跑進屋，從楊增新身上搜出一串鑰匙后匆匆離去。閻毓善又趴了一會兒，確定沒有人后，慌忙跑到學生宿舍躲避。